La controversia se centra en denuncias sobre el presunto incumplimiento de requisitos por parte de Barrios para ocupar el cargo. La elección, realizada por solo cinco de los nueve miembros del Consejo Superior, fue calificada como irregular por los aspirantes derrotados y por el Ministerio de Educación, que investiga el proceso. El ministro del Interior, Armando Benedetti, y el presidente Gustavo Petro denunciaron un "uso desproporcionado de la fuerza" contra los estudiantes durante las manifestaciones, que incluyó gases lacrimógenos y el sobrevuelo de un helicóptero sobre el campus. El presidente Petro fue contundente en su cuenta de X, ordenando una investigación a fondo y anunciando medidas drásticas: calificó el sobrevuelo como un "atentado contra la democracia en Barranquilla" y sentenció que los responsables "se van", añadiendo: "No quiero sirvientes de las mafias politiqueras". Mientras el comandante de la Policía Metropolitana negó el ingreso de uniformados al campus, voceros estudiantiles sostienen lo contrario. El rector Leyton Barrios ha llamado al diálogo, pero la comunidad académica mantiene la parálisis, a la espera de acciones legales y una posible intervención del Ministerio de Educación.