La comunidad universitaria permanece dividida, y algunos sectores habían advertido sobre la posibilidad de un nuevo paro si el fallo era adverso a Múnera. Tras conocer la decisión, Peña hizo un llamado a la reconciliación y afirmó: "Yo ya asumo la rectoría de la Universidad Nacional".
Consejo de Estado anula elección de Múnera y deja en firme a Peña como rector de la U. Nacional
La crisis institucional de la Universidad Nacional de Colombia llegó a un punto crítico luego de que el Consejo de Estado anulara el nombramiento de Leopoldo Múnera como rector. El fallo determina que la elección legal fue la de José Ismael Peña en marzo, desatando una nueva fase de incertidumbre y tensión en la principal universidad pública del país. La controversia se originó el 21 de marzo de 2024, cuando el Consejo Superior Universitario (CSU) designó a José Ismael Peña como rector, a pesar de que Leopoldo Múnera había ganado la consulta no vinculante a la comunidad académica. La elección de Peña, sumada a la negativa de la entonces ministra de Educación, Aurora Vergara, de firmar el acta, generó protestas estudiantiles y una profunda división. Meses después, en junio, el CSU, con una nueva composición y bajo la dirección del ministro de Educación ad hoc, revocó la designación de Peña y nombró a Múnera. En su decisión de única instancia del 20 de noviembre de 2025, la Sección Quinta del Consejo de Estado determinó que el CSU "actuó sin competencia" al intentar revocar un acto administrativo que ya gozaba de presunción de legalidad. Según el tribunal, el máximo órgano de la universidad, "so pretexto de corregir una irregularidad", desconoció que solo la jurisdicción contencioso-administrativa puede anular un nombramiento. Con esta sentencia, el acto administrativo que designa a Peña como rector queda en firme, lo que obliga a Múnera a dejar el cargo.



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