La universidad presentó una denuncia penal en su contra por delitos como obtención de documento público falso y daño informático. El Ministerio de Educación ha iniciado una investigación y visitas de inspección a la Fundación San José. Por su parte, Juliana Guerrero ha negado su responsabilidad, afirmando que fue la universidad la que definió la fecha de su grado y que presentará el examen para “saldar cualquier duda”. Su nombramiento en el Ministerio de la Igualdad queda en suspenso.